Além do amor entre Iracema e Martim, a obra tematiza a colonização do Amazonas e o ódio das duas nações inimigas: Tabajara e Pitiguara.

No romance, as três raças, branca, índia e negra, vivem em paz, sob a dominação da primeira.

A chegada de Martim representa uma ruptura na relação de Iracema com seu meio.

Ao dar a Martim o vinho de Tupã e entregar-se a ele, Iracema cumpre a profecia de Jurema.

Iracema dá ao filho, que simboliza o primeiro brasileiro nascido da miscigenação, o nome de Moacir, “o filho das Américas”.